Man må enes om hvordan avvik skal dokumenteres og samles, se SOP Protocol Deviation Handling, pkt. 4.2 og en plan må utarbeides, se Protocol Deviation Handling Plan.
Det beste er å ha en elektronisk webbasert løsning for å samle avvik. Dersom det ikke er mulig, må man forholde seg til papirløsning for melding av avvik, se Protocol Deviation Notification and Tracking Form. Avvikene må deretter samles i logger, se Protocol Deviation Log Single Center Study eller Protocol Deviation Log Multicenter Study.